Multiplex polymerase chain reaction diagnostic testing for respiratory pathogens in acutely ill children
Mattila, Suvi (2024-05-10)
© University of Oulu, 2024. This publication is copyrighted. You may download, display and print it for your own personal use. Commercial use is prohibited. © Oulun yliopisto, 2024. Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty.
https://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/
https://urn.fi/URN:NBN:fi:oulu-202404082592
Kuvaus
Tiivistelmä
Limited data are available on the clinical benefits of multiplex PCR testing for respiratory pathogens in acutely ill children.
Nasopharyngeal carriage of respiratory bacteria in asymptomatic children is common and the clinical interpretation of multiplex PCR results is limited by inability to separate causative pathogens from asymptomatic carriage. In the initial cross-sectional study of 1195 children with respiratory symptoms or fever, at least one bacterial pathogen was detected in 50% of the patients. Mycoplasma pneumoniae was detected in 13 patients (1.1%) and Chlamydia pneumoniae in 2 (0.2%). Detection of atypical bacteria (Mycoplasma pneumoniae or Chlamydia pneumoniae) was associated with antibiotic prescriptions and clinical diagnoses of pneumonia (aOR 14.1, 95% CI 3.98─50.1) and co-detection of Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae with an increased risk of needing respiratory support.
In the subsequent cohort study of 800 children with suspected respiratory infection the cycle threshold values in multiplex PCR testing for 21 respiratory pathogens on admission to the emergency department were not associated with hospitalization, any need for respiratory support, or any need for intensive care.
In the third study, a randomized trial including 1243 children, point-of-care multiplex PCR testing for 21 respiratory pathogens did not reduce the overall use of antibiotics in the emergency department (by 226 children [27.3%] in the intervention group vs 118 children [28.5%] in the control group) or increase targeted antibiotic prescriptions (for 12 children [1.4%] tested with point-of-care multiplex PCR vs 2 children [0.5%] in the control group). The length of stay in the emergency room was 13 minutes longer in the intervention group (183 vs 169 min).
Nasopharyngeal carriage of typical bacteria was common in children with acute respiratory illness but had little correlation with the severity of the respiratory infection. Detection of atypical bacteria was rare but correlated with clinical diagnoses of pneumonia during a non-epidemic year. Cycle threshold values for respiratory pathogens were not associated with clinical outcomes, and multiplex PCR testing for respiratory pathogens had a limited impact on clinical decision- making.
Suurin osa lasten hengitystieinfektioista on virusten aiheuttamia, mutta kliinisen taudinkuvan perusteella on usein mahdotonta erottaa viruksen aiheuttama infektio bakteerin aiheuttamasta. Multiplex-PCR-diagnostiikan käytöstä lasten hengitystieinfektioissa on rajallisesti tutkimusnäyttöä.
Hengitystiebakteerien nenänielukantajuus oireettomilla lapsipotilailla on yleistä, eikä multiplex-PCR erottele taudinaiheuttajia kolonisaatiosta. Selvitimme tunnistettujen hengitystiebakteereiden ja kliinisen taudinkuvan yhteyttä poikkileikkaustutkimuksessa, johon rekrytoitiin 1195 kuumeista tai hengitystieoireista lasta. Vähintään yksi hengitystiebakteeri tunnistettiin puolelta lapsipotilaista. Mycoplasma pneumoniae havaittiin 13 (1,1 %) lapsella ja Chlamydia pneumoniae kahdella (0,2 %) lapsella. Atyyppiset bakteerit assosioituivat antibiootin aloituksiin ja kliiniseen pneumoniadiagnoosiin (vetosuhde 14.1, 95 % LV 3,98─50,1). Streptococcus pneumoniae ja Haemophilus influenzae yhdessä lisäsivät riskiä hengitystuen tarpeelle.
Selvitimme 800 lasta sisältäneessä kohorttitutkimuksessa PCR-monistuksen kynnysarvon (CT-luku) yhteyttä kliiniseen taudinkuvaan. PCR-monistuksen kynnysarvolla ei ollut yhteyttä kliiniseen taudinkuvaan, sairaalahoidon, tehohoidon tai hengitystuen tarpeeseen.
Satunnaistetussa kontrolloidussa tutkimuksessa, johon rekrytoitiin 1243 kuumeista tai hengitystieoireista lasta, tutkimme vaikuttaako 21 hengitystiepatogeenia tutkivan multiplex-PCR vieritestin käyttö hengitystieoireisella lapsipotilaalla kliiniseen päätöksentekoon. Multiplex-PCR diagnostiikka ei vähentänyt antibioottien käyttöä (226 lasta [27,3 %] tutkimusryhmässä vs 118 lasta [28,5 %] kontrolliryhmässä, eikä lisännyt kohdennettua antiboottien käyttöä (12 [1,4 %] vs 2 lasta [0,5 %],. Päivystyskäynnin kesto oli tutkimusryhmässä merkitsevästi pidempi (183 vs 169 min, keskiarvojen ero 13 min.
Tavanomaisia hengitystiebakteereja tunnistettiin puolelta lapsipotilaista, mutta tavanomaisilla hengitystiebakteereilla ei juuri ollut yhteyttä kliiniseen taudinkuvaan. Atyyppisiä bakteereja todettiin harvoin, mutta ne olivat yhteydessä lisääntyneeseen antibioottien käyttöön ja kliiniseen pneumoniadiagnoosiin. PCR diagnostiikan kynnysarvoilla ei ollut yhteyttä kliiniseen taudinkuvaan. Multiplex- PCR testauksella ei ollut vaikutusta kliiniseen päätöksentekoon hengitystieoireisilla lapsilla.
Original papers
-
Mattila, S., Sarlin, S., Heikkilä, R., Leinonen, E., Nurmi, V., Riikonen, J., Paalanne, N., Honkila, M., Huhtamäki, H., Pokka, T., Koskela, U., Renko, M., & Tapiainen, T. (2023). Nasopharyngeal detection of atypical bacteria by multiplex polymerase chain reaction panel in acutely ill children was associated with an increased risk of pneumonia. Acta Paediatrica, 112(4), 830–836. https://doi.org/10.1111/apa.16672 https://doi.org/10.1111/apa.16672
-
Mattila, S., Honkila, M., Paalanne, N., Mäki-Koivisto, V., Halt, K., Jartti, T., Ruuskanen, O., Waris, M., Pokka, T., & Tapiainen, T. (2023). Clinical outcomes of acutely ill children according to cycle threshold values of respiratory viruses detected by multiplex pcr testing. Journal of the Pediatric Infectious Diseases Society, 12(10), 549–552. https://doi.org/10.1093/jpids/piad071 https://doi.org/10.1093/jpids/piad071
-
Mattila, S., Paalanne, N., Honkila, M., Pokka, T., & Tapiainen, T. (2022). Effect of point-of-care testing for respiratory pathogens on antibiotic use in children: A randomized clinical trial. JAMA Network Open, 5(6), e2216162. https://doi.org/10.1001/jamanetworkopen.2022.16162 https://doi.org/10.1001/jamanetworkopen.2022.16162
Osajulkaisut
-
Mattila, S., Sarlin, S., Heikkilä, R., Leinonen, E., Nurmi, V., Riikonen, J., Paalanne, N., Honkila, M., Huhtamäki, H., Pokka, T., Koskela, U., Renko, M., & Tapiainen, T. (2023). Nasopharyngeal detection of atypical bacteria by multiplex polymerase chain reaction panel in acutely ill children was associated with an increased risk of pneumonia. Acta Paediatrica, 112(4), 830–836. https://doi.org/10.1111/apa.16672 https://doi.org/10.1111/apa.16672
-
Mattila, S., Honkila, M., Paalanne, N., Mäki-Koivisto, V., Halt, K., Jartti, T., Ruuskanen, O., Waris, M., Pokka, T., & Tapiainen, T. (2023). Clinical outcomes of acutely ill children according to cycle threshold values of respiratory viruses detected by multiplex pcr testing. Journal of the Pediatric Infectious Diseases Society, 12(10), 549–552. https://doi.org/10.1093/jpids/piad071 https://doi.org/10.1093/jpids/piad071
-
Mattila, S., Paalanne, N., Honkila, M., Pokka, T., & Tapiainen, T. (2022). Effect of point-of-care testing for respiratory pathogens on antibiotic use in children: A randomized clinical trial. JAMA Network Open, 5(6), e2216162. https://doi.org/10.1001/jamanetworkopen.2022.16162 https://doi.org/10.1001/jamanetworkopen.2022.16162
Kokoelmat
- Avoin saatavuus [37744]