Supergeenit polymorfismin taustalla
Ojala, Erika (2021-04-30)
E. Ojala
30.04.2021
© 2021 Erika Ojala. Tämä Kohde on tekijänoikeuden ja/tai lähioikeuksien suojaama. Voit käyttää Kohdetta käyttöösi sovellettavan tekijänoikeutta ja lähioikeuksia koskevan lainsäädännön sallimilla tavoilla. Muunlaista käyttöä varten tarvitset oikeudenhaltijoiden luvan.
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:oulu-202105047677
https://urn.fi/URN:NBN:fi:oulu-202105047677
Tiivistelmä
Kandidaatintyössäni tarkastelen aihetta supergeenit polymorfismin taustalla. Polymorfismia esiintyy useilla eri lajeilla ja monilla lajeilla polymorfismiin on liitetty supergeeni. Tarkoituksena on selvittää kolmen esimerkkilajin kohdalla mitä yhtäläisyyksiä ja eroavaisuuksia polymorfismin ilmenemisessä löytyy. Lisäksi tarkastellaan polymorfismin syntyä esimerkkilajien kohdalla, polymorfismia ylläpitäviä voimia ja supergeenien taustaa.
Esimerkkilajeina toimivat suokukko Philomachus pugnax, valkokurkkusirkku Zonotrichia albicollis ja Etelä-Amerikan tulimuurahainen Solenopsis invicta. Suokukolla polymorfismi ilmenee kolmena eri fenotyyppinä koiraalla satellite, independent ja faeder. Valkokurkkusirkulla kolmena eri fenotyyppinä, jotka löytyvät sekä koirailta, että naarailta white, tan ja harvinainen superwhite. Tulimuurahaisilla polymorfismi ilmenee kuningatarten määränä yhdyskunnassa, joko yhden tai useiden kuningatarten yhdyskuntina.
Jokaisella esimerkkilajilla polymorfismin taustalla on osoitettu vaikuttavan supergeeni. Jokaisen esimerkkilajin supergeenin syntymekanismina toimi yksi tai useampi inversio. Inversiosta seurannut rekombinaation alenema johti esimerkkilajien kehityshistoriassa genotyyppien erilaistumiseen ja supergeenin syntyyn. Polymorfismia ylläpitäviksi voimiksi on osoitettu yleisyydestä riippuva valinta ja inversiosta johtuva rekombinaation puute. Jokaisen esimerkkilajin kohdalla polymorfismi ilmeni myös erilaistuneina haplotyyppeinä, joilla jokaisella yhdessä tai useammassa proteiinia koodaavassa geenissä oli tapahtunut erilaistumista historian saatossa.
Kysymyksiä joihin vastausta ei kirjallisuuskatsauksessa saatu ilmeni. Valkokurkkusirkun superwhite muodosta ei löytynyt yhtä laajaa aineistoa kuin white- ja tan-muodoista. Tulimuurahaisten lisäksi eroja kuningatarten määrissä yhdyskuntien välillä on havaittu myös kotoperäisillä lajeilla ja ilmiön levinneisyyden laajuus muurahaislajien keskuudessa kaipaisi kartoitusta. Lisäksi supergeenien osuudesta polymorfismin taustalla löytyy myös verrattain vähän aineistoa ja ilmiöön liittyy vielä paljon tuntemattomia tekijöitä.
Esimerkkilajeina toimivat suokukko Philomachus pugnax, valkokurkkusirkku Zonotrichia albicollis ja Etelä-Amerikan tulimuurahainen Solenopsis invicta. Suokukolla polymorfismi ilmenee kolmena eri fenotyyppinä koiraalla satellite, independent ja faeder. Valkokurkkusirkulla kolmena eri fenotyyppinä, jotka löytyvät sekä koirailta, että naarailta white, tan ja harvinainen superwhite. Tulimuurahaisilla polymorfismi ilmenee kuningatarten määränä yhdyskunnassa, joko yhden tai useiden kuningatarten yhdyskuntina.
Jokaisella esimerkkilajilla polymorfismin taustalla on osoitettu vaikuttavan supergeeni. Jokaisen esimerkkilajin supergeenin syntymekanismina toimi yksi tai useampi inversio. Inversiosta seurannut rekombinaation alenema johti esimerkkilajien kehityshistoriassa genotyyppien erilaistumiseen ja supergeenin syntyyn. Polymorfismia ylläpitäviksi voimiksi on osoitettu yleisyydestä riippuva valinta ja inversiosta johtuva rekombinaation puute. Jokaisen esimerkkilajin kohdalla polymorfismi ilmeni myös erilaistuneina haplotyyppeinä, joilla jokaisella yhdessä tai useammassa proteiinia koodaavassa geenissä oli tapahtunut erilaistumista historian saatossa.
Kysymyksiä joihin vastausta ei kirjallisuuskatsauksessa saatu ilmeni. Valkokurkkusirkun superwhite muodosta ei löytynyt yhtä laajaa aineistoa kuin white- ja tan-muodoista. Tulimuurahaisten lisäksi eroja kuningatarten määrissä yhdyskuntien välillä on havaittu myös kotoperäisillä lajeilla ja ilmiön levinneisyyden laajuus muurahaislajien keskuudessa kaipaisi kartoitusta. Lisäksi supergeenien osuudesta polymorfismin taustalla löytyy myös verrattain vähän aineistoa ja ilmiöön liittyy vielä paljon tuntemattomia tekijöitä.
Kokoelmat
- Avoin saatavuus [34329]